DNA甲基化實驗服務
甲基化檢測
DNA的甲基化(Methylation) 是早發現的基因表觀修飾之一,甲基化僅修飾胞嘧啶,DNA的甲基化修飾是在DNA甲基化轉移酶的作用下使CpG雙核苷酸5端的胞嘧啶轉變為5-甲基胞嘧啶,由于CpG島主要位于基因的啟動子和第--外顯子區域,其甲基化修飾通常抑制基因的表達,去甲基化后基因重新活化和表達。DNA甲基化修飾方式在不改變基因序列的前提下實現對基因表達的調控。
主要檢測方式
1. MSP:甲基化特異性PCR (Methylation-specific PCR)即用亞硫酸氫鹽處理基因組DNA.未甲基化的胞嘧啶被轉化為尿嘧啶,甲基化的胞嘧啶不會發生改變,設計針對甲基化序列的引物進行PCR擴增,然后通過電泳等檢測手段檢測MSP擴增產物來確定位點是否存在甲基化。
2. BSP:亞硫酸氫鹽測序法(Bisulfite sequencing PCR)與MSP相似,用亞硫酸氫鹽將未甲基化胞嘧啶轉化為尿嘧啶,設計BSP引物進行PCR,擴增中尿嘧啶全部轉化為胸腺嘧啶,對PCR產物進行測序來判斷CpG位點是否甲基化。
HRM:高分辨率溶解曲線法(High Resolution Melting)原理也是用亞硫酸氫鹽處理。未甲基化的胞嘧啶經PCR擴增變成胸腺嘧啶,樣品中的GC含量發生變化從而溶解溫度發生變化,從而確定位點是否發生甲基化。基于限制性內切酶的
測序方法:
1.靶向富集甲基化位點的測序方法
2. SMRT測序法
結果展示
Assay Name: miR-152-S1(8CpG)
Sample ID: Si
Note:
實驗完成周期及交付標準
1.實驗周期: 3-5周
2.交付標準:甲基化檢測結果、實驗報告(實驗步驟、試劑、儀器等)
需確認的信息
1.目的基因及種屬
2.樣本類型(細胞、組織、血液等)
3.目的基因片段
參考文獻
[1] Sato S , Uemoto Y , Kikuchi T , et al. SNP- and haplotype-based genome-wide association studies for growth,
carcass, and meat quality traits in a Duroc multigenerational population[J]. Bmc Genetics, 2016, 17(1):60.
[2] Ichikawa K, Tomioka S , Suzuki Y , et al. Centromere evolution and CpG methylation during vertebrate speciation[J].
Nature Communications, 2017. 8(1):1833.
[3] Yang Y , Scott S A. DNA Methylation Profling Using Long-Read Single Molecule Real-Time Bisulfite Sequencing
(SMRT-BS)[J] Methods Mol Biol, 2017, 1654:125-134.
[4]Yang Y , Sebra R,Pullman B S , et al. Quantitative and multiplexed DNA methylation analysis using long-read
single-molecule real-time bisulfite sequencing (SMRT-BS).J]. Bmc Genomics, 2015, 16(1):350.
收費標準/服務周期/提供結果:
歡迎咨詢詳談,我們會根據您的方案及需求制定詳細的服務協議。
更多實驗技術服務請瀏覽網站其他內容,或來電詳詢! .
從2011年開始我們致力于在生命科學領域、生物醫學實驗外包及論文潤色服務,協助客戶各類實驗服務及論文潤色十余年,是客戶您值得信賴的科研合作伙伴!
如果您受時間、試驗條件等限制而無法完成您的課題研究,歡迎您與我們聯系。
實驗代做服務:
WB代做 | HE染色 | 免疫熒光染色 | 蛋白相互作用分析 |
ELISA免費代檢測 | 免疫組化 | 熒光定量PCR | 番紅O固綠染色 |
流式細胞分選技術 | 激光共聚焦 | 透射電鏡服務 | DNA甲基化實驗 |
免疫共沉淀(Co-IP) | DNA甲基化 | 掃描電鏡實驗 | 石蠟冰凍切片TUNEL凋亡熒光 |
免疫組化IHC染色 | 分子克隆和質粒載體構建服務 | 原位雜交(FIsh) | 石蠟/冰凍切片凋亡 |
RNA結合蛋白免疫沉淀(RIP) | CCK8檢測 | 蛋白雙向(2-D)電泳 | 蛋白雙向2D-WB |
ATP/ADP檢測 | Taqman探針 | 細胞劃痕 | 基因組DNA提取 |