pBM16A Toposmart Cloning Kit
產品信息: |
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組 成 | YCL071-01 | YCL071-02 |
pBM16A Vector (20ng/ml ) | 20ml | 20ml×3 |
10×Toposmart | 20ml | 20ml×3 |
Control Insert | 5ml | 5ml |
M13F Primer | 0.1OD | 0.1OD×3 |
M13R Primer | 0.1OD | 0.1OD×3 |
保存條件:-20℃保存,有效期一年。產品介紹:
pBM16A Toposmart克隆試劑盒利用痘苗病毒的拓撲異構酶I(Topoisomerase I)的切割再連接的特點將片段克隆到載體中。不僅適用于克隆由Pfu、KOD、Xerox、Phusion 和Q5等高保真DNA聚合酶擴增的平末端PCR產物,也可克隆由Taq、Tth和klenTaq等DNA聚合酶擴增的帶A尾的PCR產物。試劑盒中的pBM16A載體為線性化的質粒。可以用引物對M13F和M13R進行菌落PCR鑒定陽性克隆。
(1)連接反應僅需 5 分鐘。
(2)適用于平末端PCR產物和帶A尾的PCR產物。
(3)載體采用了新的制備工藝,無需藍白斑篩選。
1. 連接反應
按下表,在一個 0.2ml PCR 管中依次加入
成分 | 體積 |
DNA --片段 | 0.5-8µl |
pBM16A Topo載體 | 1ml |
10×Toposmart | 1ml |
補水至總體積 | 10ml |
加完試劑后,輕輕混勻低速離心,使溶液集中在管底。
注意:此步驟不要在低溫條件下(冰水?。┥喜僮鳌?/span>
2. 反應溫度及片段要求
室溫下(20-30℃)放置 0-5 分鐘,然后將離心管放置在冰上。如當天不進行轉化實驗。請將連接產物置于-20℃保存。
注意:DNA-- 片段的用量見下表
片段大小(bp) | 建議用量(ng) |
100-1000 | 20-50 |
1000-2000 | 50-100 |
2000-5000 | 100-200 |
室溫下(20-30℃)反應時間 5-30 分鐘,如果室溫較低,推薦使用 PCR 儀器控制溫度。可以設置 25℃反應 5 分鐘。如果 PCR 產物電泳檢測僅有很銳利明亮的條帶,無引物二聚體和非特異性條帶存在,可直接取 0.5-1µl PCR 產物原液進行克隆。
取 1µl 試劑盒提供的 1kb 長度的對照片段 LacZ 基因α肽片段進行克隆,轉化具有α 互補功能的大腸桿菌感受態細胞(如 DH5α,*0,Mach1-T1 等)。菌液涂布在含有IPTG,X-gal 的 LB 氨芐平板上,次日藍色菌落為陽性克隆,說明有片段插入,白色菌落為空載體。
1.取 5µl 連接產物到 50-100µl 剛剛融化的感受態細胞中,輕輕混勻,冰浴 2-30 分鐘。
2.42℃水浴中熱擊 30 秒鐘。
3. 立刻置于冰水浴中 2 分鐘。
加入 300-500µl 無菌的不含抗生素的 SOC 或LB,37℃,200-250rpm 振蕩培養 60 分鐘。
5. 陽性重組子的鑒定菌落 PCR
(1) 菌落PCR方法鑒定陽性克隆
① 用10ml吸頭挑選克隆至預先加有10μl無菌水或LB培養基的PCR管中,吹打混合。
② 25ml PCR反應體系:取2μl細菌懸液為模板、加入5μM 濃度的M13F/M13R各
1μl進行PCR擴增。
③PCR擴增條件:95℃預變性5分鐘(裂解細胞,失活核酸酶),94℃變性10秒鐘,55℃退火10秒鐘,72℃延伸( 根據片段的大小決定延伸時間,通常每1min/1kb)X秒,30個循環,72℃后延伸5分鐘。1%瓊脂糖凝膠電泳分析擴增結果,有強烈的明顯條帶的克隆為重組體,與插入片段大小相近(M13F/M13R 引物在克隆位置的兩側,所以PCR擴增出的DNA的長度比插入片段大138bp) 可視為陽性克隆。菌落PCR方法鑒定重組子時一定要設立一個不加菌液的陰性對照。
(2) 測序:用M13F、M13R通用引物對陽性質粒進行測序分析。
pBM16A載體圖譜
常見問題分析
重組子克隆菌少,或陽性率低:
(1) 感受態效率低,使用轉化效率>5×107cfu/µg 的感受態細胞
(2) 連接反應在低溫下(如放碎冰上)操作,應該在室溫下操作。
(3) PCR 片段加入量太多或太少,按照推薦量加入。
(4) PCR 純度低,重新擴增或重新純化PCR 產物。
(5) PCR 質量低,切膠時在紫外下照射時間長,需重新制備。
(6) PCR 擴增結束后,應該再延伸 5-10 分鐘,確保片段延伸*。
(7) 轉化后沒有復蘇培養,可以加入 SOC 或LB,培養 60 分鐘。
>pBM16A Topo AGTGAGTTGATTGTGTAAAACGACGGCCAGTGTCTGAGGCTCGCTTCAGTCCTGATGCTTGATATCCCGGGCGT GTCGCCCTT$$$$AAGGGCGACACGCCCGGGATATCGCGTCTGCCTGAAGTCAATACTGACGATGGTCATAGCT GTTTCCTGTCCATAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTTGATCGGCACGTAAGAGGTTCC AACTTTCACCATAATGAAATAAGATCACTACCGGGCGTATTTTTTGAGTTATCGAGATTTTCAGGAGCTAAGGA AGCTAAAATGAGTATTCAACATTTCCGTGTCGCACTTATTCCGTTTTTTGCGGCATTTTGCCTTCCTGTTTTTG CTCACCCAGAAACGCTGGTGAAAGTAAAAGATGCTGAAGATCAGTTGGGTGCACGAGTGGGTTACATCGAACTG GATCTCAACAGCGGTAAGATCCTTGAGAGTTTTCGCCCCGAAGAACGTTTTCCAATGATGAGCACTTTTAAAGT TCTGCTATGTGGCGCGGTATTATCCCGTATTGACGCCGGGCAAGAGCAACTCGGTCGCCGCATACACTATTCTC AGAATGACTTGGTTGAGTACTCACCAGTCACAGAAAAGCATCTTACGGATGGCATGACAGTAAGAGAATTATGC AGTGCTGCCATAACCATGAGTGATAACACTGCGGCCAACTTACTTCTGACAACGATCGGAGGACCGAAGGAGCT AACCGCTTTTTTGCACAACATGGGGGATCATGTAACTCGCCTTGATCGTTGGGAACCGGAGCTGAATGAAGCCA TACCAAACGACGAGCGTGACACCACGATGCCTGTAGCAATGGCAACAACGTTGCGCAAACTATTAACTGGCGAA CTACTTACTCTAGCTTCCCGGCAACAATTAATAGACTGGATGGAGGCGGATAAAGTTGCAGGACCACTTCTGCG CTCGGCCCTTCCGGCTGGCTGGTTTATTGCTGATAAATCTGGAGCCGGTGAGCGTGGCTCTCGCGGTATCATTG CAGCACTGGGGCCAGATGGTAAGCCCTCCCGTATCGTAGTTATCTACACGACGGGGAGTCAGGCAACTATGGAT GAACGAAATAGACAGATCGCTGAGATAGGTGCCTCACTGATTAAGCATTGGTAATGAGGGCCCAAATGTAATCA CCTGGCTCACCTTCGGGTGGGCCTTTCTGCGTTGCTGGCGTTTTTCCATAGGCTCCGCCCCCCTGACGAGCATC ACAAAAATCGATGCTCAAGTCAGAGGTGGCGAAACCCGACAGGACTATAAAGATACCAGGCGTTTCCCCCTGGA AGCTCCCTCGTGCGCTCTCCTGTTCCGACCCTGCCGCTTACCGGATACCTGTCCGCCTTTCTCCCTTCGGGAAG CGTGGCGCTTTCTCATAGCTCACGCTGTAGGTATCTCAGTTCGGTGTAGGTCGTTCGCTCCAAGCTGGGCTGTG TGCACGAACCCCCCGTTCAGCCCGACCGCTGCGCCTTATCCGGTAACTATCGTCTTGAGTCCAACCCGGTAAGA CACGACTTATCGCCACTGGCAGCAGCCACTGGTAACAGGATTAGCAGAGCGAGGTATGTAGGCGGTGCTACAGA GTTCTTGAAGTGGTGGCCTAACTACGGCTACACTAGAAGAACAGTATTTGGTATCTGCGCTCTGCTGAAGCCAG TTACCTCGGAAAAAGAGTTGGTAGCTCTTGATCCGGCAAACAAACCACCGCTGGTAGCGGTGGTTTTTTTGTTT GCAAGCAGCAGATTACGCGCAGAAAAAAAGGATCTCAAGAAGATCCTTTGATTTTCTACCGAAGAAAGGCCCAC CCGTGAAGGTGAGCC
本產品僅供研究不用于臨床診斷